很多人在使用过移动环保厕所后发现，在抽完马桶之后，只有很少的气味遗留，不像之前的厕所，每次上完厕所都臭气熏天的，很多人奇怪这个问题，其实这和移动环保厕所独有的污物处理方式是离不开的。
目前所使用的移动环保厕所粪便的处理方法如下：
一、水冲与无水冲抽吸式移动厕所：
水冲式移动厕所内有水冲装置，一般将水箱置于厕所顶部，厕所底部设置有污水箱，而无水冲式移动厕所则没有冲水装置，由设置于厕所底部的污水箱直接承接使用人员的排泄物。由于这两种形式的移动厕所污水箱容量较小，当使用到规定人数时，需要及时抽吸，否则容易发生满溢事件，抽吸频率较高。
二、干式打包型移动厕所：
该种移动厕所没有水冲装置，排泄物由放置于洁具下部的可降解塑料袋承接，每使用一人次，自动换置另一新的塑料袋，用完后将塑料袋集中收集运往处理厂处置。这种移动厕所的特点是完全不用水冲，节约水资源，污物收集比较方便。
三、循环水冲型移动厕所：
该种移动厕所配置有间歇式好氧与厌氧处理粪便污水装置，另再添加生物菌种，运用生物膜技术，加速粪便污水的发酵分解，然后通过过滤装置，将经处理的粪便污水再循环用于冲洗厕所洁具，其特点是运用了先进的粪便污水处理技术，节约宝贵的水资源，减少粪便污水抽吸次数，环保理念得到充分彰显。
